Можно ли в программе оперировать несколькими юридическими лицами одного холдинга и отслеживать взаиморасчеты с единым собственником?

Да. В программе можно оформлять документы от имени нескольких организаций, имеющих различные юридические лица. Взаиморасчеты с контрагентами ведутся с единым собственником – компанией, которая объединяет все эти организации. В то же время предусмотрена возможность контроля остатков товаров в рамках каждой организации.